Jean-Baptiste LAMY ("Jiba")
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Activités de recherche
Je termine actuellement une thèse en informatique médicale au laboratoire LIM&BIO (Laboratoire d'Informatique Médicale et de BIO-informatique, à Bobigny). Ce travail de thèse s'intitule "Conception et évaluation de méthodes de visualisation des connaissances médicales : mise au point d'un langage graphique et application aux connaissances sur le médicament", et est réalisé sous la direction d'Alain Venot.Les connaissances médicales sont de plus en plus nombreuses. Lors des consultations, les professionnels de santé n'ont généralement pas le temps nécessaire pour consulter ces connaissances.
C'est pourquoi nous proposons d'accelérer l'accès aux connaissances avec le langage graphique de Visualisation des Connaissances Médicales (VCM). Ce langage représente sous forme d'icônes les principaux concepts médicaux (pathologies, caractéristiques du patient, traitements, surveillances,...). Ces icônes peuvent ensuite être combiner pour former des phrases médicales. Enfin, plusieurs interfaces de visualisation permettent d'enrichir les textes médicaux existants avec les icônes VCM.
Au cours de ma thèse, j'ai conçu le langage VCM sur de solides bases médicales et cognitives, ainsi que les interfaces graphiques associées. Ces outils ont été appliqués aux connaissances sur le médicament, et notamment aux Résumés des Caractéristiques Produits (RCP, monographie), puis évalués dans des conditions contrôlées.
Activités dans le monde du logiciel libre
Dans le monde du logiciel libre, j'ai réalisé plusieurs jeux vidéo (dans l'ordre chronologique : Arkanae, Slune, Balazar et Balazar Brothers), un moteur de 3D (Soya) ainsi qu'un éditeur de tablature (Songwrite). Ces logiciels sont disponibles sur le site oueb d'OOmadness (à l'exception d'Arkanae qui n'est plus maintenu mais peut être trouvé sur Internet). Mon goût pour les langages de programmation simples et orientés objets m'a conduit à être l'un des premiers à developper des jeux et des applications dans ces langages (Java et Python).Je suis fortement impliqué dans l'association Nekeme Prod., qui a pour objectif de développer et de soutenir les jeux vidéo libres.
Je suis régulièrement présent aux conférences ou salons du libre en France (RMLL, Rencontres Mondiales du Logiciel Libre, Solutions Linux, Game Over, Libr'East...).
Autres activités
J'ai toujours un roman en cours d'écriture et j'écris aussi des chansons à la guitare... en attendant que tout cela soit disponible, vous pouvez toujours lire La petite fille du désert.Activités passées
2001-2003 : recherche sur les appartements intelligents pour la santé
Lors de mes stages de DEA et de 5ème année de pharmacie recherche, j'ai travaillé sur le concept d'appartement intelligent pour la santé au sein de l'équipe AFIRM du laboratoire TIMC-IMAG, à Grenoble, sous la direction de Vincent Rialle.Mes recherches ont notamment portées sur la reconnaissance et la reconstitution en 3D de scénarios de la vie quotidienne ou correspondant à des comportements pathologiques. L'écriture des scénarios s'est réalisée lors d'un stage à Sherbrooke (Québec), encadré par Hélène Pigot.
Diplômes
- Doctorat en Informatique médicale (Paris 6)
- Docteur en Pharmacie
- DEA Informatique Médicale et Technologie de la Communication (Paris 6)
- Maîtrise des Sciences Biologiques et Sociales (MSBM)
Publications et communications
(Si vous n'arrivez pas à vous procurer ces publications, demandez-les moi par email).- Lamy, J.-B., Ellini, A., Ebrahiminia, V., Zucker, J.-D., Falcoff, H. et Venot, A. Use of the C4.5 machine learning algorithm to test a clinical guideline-based decision support system. Proceedings of Medical Informatics Europe (MIE2008). Göteborg, Suède, 28/05/2008.
- Lamy, J.-B., Duclos, C., Bar-Hen, A., Ouvrard, P. et Venot, A. An iconic language for the graphical representation of medical concepts. BMC Medical Informatics and Decision Making, 8:16, 2008, commenté dans Science 2/05/2008 320:591.
- Lamy, J.-B., Venot, A., Bar-Hen, A., Ouvrard, P. et Duclos, C. Design of a graphical and interactive interface for facilitating access to drug contraindications, cautions for use, interactions and adverse effects. BMC Medical Informatics and Decision Making, 8:21, 2008.
- Lamy, J.-B. Conception et évaluation de méthodes de visualisation des connaissances médicales : Mise au point d'un langage graphique et application aux connaissances sur le médicament, thèse de science, 2006.
- Lamy, J.-B., Duclos, C., Rialle, V. et Venot, A. Vers une méthode rigoureuse de conception des langages graphiques s'appuyant sur les sciences cognitives. In F. Poulet and B. Le Grand, editors, 4ème atelier visualisation et extraction de connaissances, 6èmes journées francophones d'Extraction et de Gestion des Connaissances. Lille, France, 17/1/2006.
- Lamy, J.-B., Duclos, C., Rialle, V. et Venot, A. Which graphical approaches should be used to represent medical knowledge?. Proceedings of Medical Informatics Europe (MIE2005). Geneva, 30/8/2005.
- Lamy, J.-B., Duclos, C., Rialle, V. et Venot, A. Classification et analyse critique des approches graphiques appliquées à la visualisation des connaissances médicales. Journées Francophones d'Informatique Médicale (JFIM2005), pages 1-9. Lille, 13/5/2005.
- Lamy, J.-B., Duclos, C., Rialle, V. et Venot, A. Which graphical approaches should be used to represent medical knowledge?. Studies in health technology and informatics, 116:719-724, 2005.
- Lamy, J.-B., Duclos, C., Rialle, V. et Venot, A. Quelles approches graphiques pour faciliter la diffusion des connaissances médicales ?. 5ème congrès Internet et Pédagogie Médicale (IPM 2004), pages 39-40. Grenoble, 3/12/2004.
- Rialle, V., Lamy, J.-B., Noury, N. et Bajolle, L. Telemonitoring of patients at home: A Software Agent approach. Computer methods and programs in Biomedicine, pages 257-268, 72 (3) 2003.
- Lamy, J.-B. Reconnaissance de scénarios, application à la télé-surveillance médicale à domicile. Mémoire de DEA, 2003.
- Rialle, V., Noury, N., Bajolle, L., Lamy, J.-B., Virone, G., Duchêne, F., Moha, N. et Demongeot, J. Le concept d'Habitat Intelligent pour la Santé: considérations techniques et scientifiques pour un service médico-social. Revue de Gériatrie, 2003.
- Lamy, J.-B. Télé-surveillance médicale: conception d'un système d'analyse temporelle, validation par simulation et reconstitution par réalité virtuelle. Mémoire de 5ème année de pharmacie, option recherche, 31/5/2002.